会員さんがいつ来店したか（チェックイン履歴）は見られますか？

残ります。サブスクの利用(チェックイン)ログとして、日時・どの店舗か・チェックインの種別(受付での手動／モバイルオーダー／予約経由)まで記録されます。

この履歴を使うと「最近来ていない会員」を見つけて掘り起こし配信をする、といった運用ができます。
ラベルやユーザーグループの条件(最終来店からの経過など)と組み合わせると、休眠会員へのアプローチがしやすくなります。

しばらく来ていない会員を抽出して、復帰クーポンを送るのに使っています。
来店履歴が残っているからこそできる施策です。