外部ツールと併用する予定です。LINEアカウントやLIFFアプリの設定は必要ですか？

必要です。LINEアカウント設定・LIFFアプリ設定は初期設定であり、サブスクラインの機能を使うために必須です（LINE公式アカウント一覧・LIFFアプリ一覧）。

ただし、サブスクライン側でWebhookイベントを受信しない前提であれば、Messaging APIのエンドポイントURL（Webhook URL）の書き換えまでは必須ではありません。その場合、メッセージ受信やイベント受信ができないため、一部機能が正常に動作しない点をご了承ください。

解決しませんか？ マニュアルで解決しない疑問は質問フォーラムで検索・質問できます。